9. 分子团簇

分子团簇模块主要用于对含多个分子的结构进行单个分子操作。通过操作，可以精细调整不同分子间的相对位置与朝向。

• 分子判定：对于一个结构，MView是根据它的键信息判定分子类别的。也就是说，如果输入文件中两个原子间有键连接，即便它们之间距离很远，MView也认为它们属于同一个分子。

当MView中包含结构数据时，【分子团簇】按钮亮起，点击即可进入分子团簇窗口，目前，窗口中包含5个操作。

9.1. 查看单个分子信息

操作1，用于查看单个分子的信息，可以查看以下内容。

• 原子构成：不同原子的编号以及原子符号，编号与MView主界面显示的原子编号一致。

• 几何中心：分子各个原子坐标的平均值。

• 质心：分子的质心。

• 拟合平面：分子的最佳拟合平面，对近平面分子意义较大。

9.2. 移动单个分子

操作2，对结构中的单个分子进行平移、旋转等操作。

• 中心移至原点：平移指定分子使其中心与坐标原点重合。

• 质心移至原点：平移指定分子使其质心与坐标原点重合。

• 平行xy平面：旋转指定分子使其与xy平面平行，与z轴垂直。

• 平行xz平面：旋转指定分子使其与xz平面平行，与y轴垂直。

• 平行yz平面：旋转指定分子使其与yz平面平行，与x轴垂直。

9.3. 设置分子间朝向

操作3，通过旋转第二个指定的分子使其与第一个指定的分子平行或者垂直。

9.4. 设置分子间距离

操作4，通过平移第二个指定的分子与第一个指定的分子中心距离为设定的距离。

9.5. 对齐分子

操作5，先旋转指定的第二个分子，使其与指定的第一个平行，再将其沿平行平面平移与旋转，使两个分子尽可能重合。此操作对两个近平面分子意义较大。