4. 创建扫描文件
MView可以创建用于扫描的输入文件。
4.1. 扫描输入文件
选择合适的扫描变量,并选定对应的原子标签,可以得到当前分子结构下变量的对应数值。 此处输入的原子标签与MView主页面显示分子时元素名称前的原子标签一致,最小值为1,最大值为原子数目。 在设定合适的扫描步数与扫描步长后,点击【保存扫描输入文件】,可以保存对应的扫描输入文件。
目前支持的保存文件类型有
Gaussian输入文件(.gjf)
ORCA allxyz文件(.allxyz)
xTB输入文件(.inp)
多个分子结构文件(.mol)
4.2. 快速扫描
在使用Gaussian16作为计算引擎时,可以使用MView的快速扫描功能,初步查看待扫描的势能面能量变化情况。
快速扫描基本设置与设置扫描输入文件相同,在完成扫描变量,扫描步数与扫描步长的设置后,单击快速扫描功能,MView将会调用Gaussian并使用UFF力场进行快速扫描。 扫描完成后下方图片界面将会显示扫描结果。
点击保存结果按钮可以将快速扫描结果进行保存。