手把手教你用Materials Studio计算明星MOF材料UiO-66的Connolly surface!

Connolly surface是表示多孔材料表面的一种方法,往往通过探针(球状)在材料表面滚过后探针表面画出的面积,如下图Connolly surface位于Connolly探针与原子(以它们缩放后的vdW半径表示)的边界上,而不是探针中心的轨迹上。改变Connolly曲面的Connolly探针半径往往会改变vdW表面上的尖点和褶皱处的曲率,但在这些区域之外,Connolly曲面遵循vdW表面。

手把手教你用Materials Studio计算明星MOF材料UiO-66的Connolly surface!

具体计算步骤如下:

步骤1:导入 CIF 文件并可视化

1. 打开 Materials Studio,新建一个项目(Project)。  

2. 在菜单栏点击 File → Import,选择 UiO-66 的 CIF 文件(可从 CCDC、Materials Project 等数据库下载)。 

3. 确认结构正确显示在 3D 视图中。

手把手教你用Materials Studio计算明星MOF材料UiO-66的Connolly surface!
手把手教你用Materials Studio计算明星MOF材料UiO-66的Connolly surface!

步骤2:调整显示方式

1. 通过点击鼠标右键打开Display Style,调整为球棍模型。

手把手教你用Materials Studio计算明星MOF材料UiO-66的Connolly surface!

步骤3:通过菜单栏Tools→Atom Volumes &Surfaces

手把手教你用Materials Studio计算明星MOF材料UiO-66的Connolly surface!

步骤4:计算 Connolly Surface 

1. 打开结构文件:确保优化后的 UiO-66 结构处于激活状态。  

2. 进入表面分析模块:点击菜单栏 Modules → Tools → Surface Analysis。   

3. 设置 Connolly Surface 参数:

Surface Type:选择 Connolly Surface,其他参数默认。

4.  运行计算:点击Create,等待计算完成。

手把手教你用Materials Studio计算明星MOF材料UiO-66的Connolly surface!

步骤5:通过点击鼠标右键打开Display Style,isosurface进行个性化调整

手把手教你用Materials Studio计算明星MOF材料UiO-66的Connolly surface!

步骤6:通过工具栏进行其他效果的调整

步骤7:导出结果

保存图像:截图或通过 File → Export 保存为图片格式(bmp)。

声明:如需转载请注明出处(华算科技旗下资讯学习网站-学术资讯),并附有原文链接,谢谢!
(0)
上一篇 9小时前
下一篇 9小时前

相关推荐