杨站长脚本
1. 高通量计算
对文件夹中所有结构进行自动计算并输出结果,可做结构优化、单点能、能带态密度计算。
使用方法:将脚本放入所有结构所在文件夹即可。
2. 相互作用能
通过分子动力学计算,求每帧中两个片段间相互作用能的平均值。
使用方法:见压缩包中pdf。
3. 截断能收敛性测试
每隔50 eV取一个截断能,给出单点能与截断能之间的关系,帮助判断合理截断能。
使用方法:将脚本与目标结构放在同一文件夹,并将脚本里$doc的名字改成目标结构xsd名字。
4. 转xtd轨迹为xyz
将MS中的xtd轨迹结构格式转换为各软件通用的xyz格式。
使用方法:将脚本与目标结构放在同一文件夹,并将脚本里$doc的名字改成目标结构xsd名字。
5. 转换EAM为off
将网上下载的EAM tabulated力场专为MS Forcite模块能用的.off格式。
使用方法:将脚本与目标结构放在同一文件夹。