VMD最大的优势就是简单和灵活，提供出色的绘图功能和操作简单，便捷快速，安装简单，非常易于使用。如果你没有任何分子建模的经验，建议从VMD入手，至少可视化的操作和友好的界面不会打击你建模的耐心。
VMD的作图能力非常优秀，操作简单，方便快捷，经常用来制作期刊封面、文章示意图等，下面的Nature、Science封面就用VMD绘制的。
本文包括专为新手制作的一套VMD课程，共30节，外加美国阿贡国家实验室VMD培训课程和课件，课程是英文，但发音清晰对初学者友好。
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