从晶体到单层:Materials Studio构建石墨烯的两种高效方法

石墨烯Graphene)作为材料科学领域的明星材料,以其独特的单层碳原子结构和优异的物理化学性质,吸引了无数科研工作者的目光。无论是电子器件、能源存储,还是复合材料,石墨烯都展现出了巨大的应用潜力。那么,如何利用Materials Studio这一强大的材料模拟工具,快速构建单纯石墨烯结构呢?本文将为你详细讲解两种构建单层石墨烯的方法,带你从零开始,轻松构建石墨烯模型!

方法一:通过删减原子层来构建

1.导入石墨烯结构

从菜单栏中选择File > Import…

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2.在弹出的Import Document对框中,打开Structures>ceramics>graphite.msi左键双击这个结构,或点击下方“打开”导入石墨烯的晶体结构。

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3.鼠标右键打开Display Style,在Atom中修改成Ball and stick模型,可以看到,此时的模型中有两层石墨,接下来,我们需要删掉其中的一层。

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4.消除对称性并删除原子

1)导入的石墨烯结构,是有对称性的,上下两次是等价对称的,当直接选中其中一层,右键Delect删除时,两层都会被删掉。

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2)从菜单栏中选择Build > Symmetry >Make P1,消除晶体的对称性。

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3)这时,再去删除一层原子,就可以了。

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5.调整c轴长度

对于单层表面结构,为了避免c方向上的周期性镜像的影响,往往需要大于10 Å的真空层。

1)鼠标右键打开Lattice Parameters,可以看到,此时c轴的长度是6.8 Å,太小了,需要去修改增大。

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2)在修改之前,打开Advanced 界面,把Keep fractional coordinates fixed during changes to the lattice之前的√去掉。

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3)返回Parameters界面,将c改为15,这时,真空层就是15 Å了。

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(注意,不是所有结构这里c设置为15,真空层就是15 Å,这里设置15,是因为只有一层原子,实际上还需要考虑底层和顶层的间距,例如,底层和顶层的间距是5 Å,那c轴的总长度就是15+5=20

6.构建超胞

1)从菜单栏中选择Build > Symmetry >Supercell,打开Supercell对话框。

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2)设置超胞为5×5×1(对于表面模型,只需要在ab两个方向扩胞就行),点击Create Supercell按钮,生成包含25个初始单位晶胞的超胞结构。

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方法二:通过构建001面表面模型来实现

1.构建(001)表面

1)从菜单栏中选择Build > Surfaces > Cleave Surface,打开Cleave Surface对话框。

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2)Cleave plane (h k l)中,默认面为(-1 0 0)面,根据需要可以自定义修改,这里我们输入0 0 1(注意:每个数字需要用空格隔开),Thickness设置成0.5

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3)设置好后,点击下方的CleaveMS中会多出一个名为“graphite (0 0 1).xsd”的文件,这个就是单层石墨烯,目前还是一个2D结构,需要添加真空层,变成一个3D结构。

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2.添加真空层

1)从菜单栏中选择Build > Crystals >Build Vacuum Slab…,打开Build Vacuum Slab Crystal对话框。

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2)Vacuum Slab选项卡中, Vacuum thickness可以设置真空层的厚度,一般要大于10 Å,这里我们设置15 Å

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3)点击Build,这是就得到了一个单层是模型的表面模型了。

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3.构建超胞

具体步骤同方法一,这里不再具体讲述。

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